Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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