Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
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