Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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