Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
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