Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms