Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD2Q13200 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD2Q13200 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms