Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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FOXD4Q12950 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXD4Q12950 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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