Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TROQ12816 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TROQ12816 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TROQ12816 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TROQ12816 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
TROQ12816 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TROQ12816 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TROQ12816 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TROQ12816 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TROQ12816 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TROQ12816 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TROQ12816 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TROQ12816 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TROQ12816 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TROQ12816 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TROQ12816 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TROQ12816 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TROQ12816 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TROQ12816 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TROQ12816 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TROQ12816 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TROQ12816 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TROQ12816 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TROQ12816 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TROQ12816 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
TROQ12816 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TROQ12816 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TROQ12816 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
TROQ12816 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
TROQ12816 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TROQ12816 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TROQ12816 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TROQ12816 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TROQ12816 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TROQ12816 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TROQ12816 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TROQ12816 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
TROQ12816 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TROQ12816 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TROQ12816 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TROQ12816 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TROQ12816 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TROQ12816 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TROQ12816 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TROQ12816 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TROQ12816 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TROQ12816 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TROQ12816 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TROQ12816 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TROQ12816 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TROQ12816 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TROQ12816 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TROQ12816 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TROQ12816 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TROQ12816 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TROQ12816 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TROQ12816 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TROQ12816 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
TROQ12816 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TROQ12816 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TROQ12816 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TROQ12816 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TROQ12816 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TROQ12816 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TROQ12816 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TROQ12816 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TROQ12816 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TROQ12816 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TROQ12816 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TROQ12816 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TROQ12816 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TROQ12816 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TROQ12816 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TROQ12816 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TROQ12816 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TROQ12816 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TROQ12816 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TROQ12816 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TROQ12816 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TROQ12816 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TROQ12816 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TROQ12816 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TROQ12816 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TROQ12816 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TROQ12816 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TROQ12816 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TROQ12816 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TROQ12816 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TROQ12816 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TROQ12816 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TROQ12816 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TROQ12816 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TROQ12816 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TROQ12816 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TROQ12816 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TROQ12816 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TROQ12816 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TROQ12816 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TROQ12816 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TROQ12816 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
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