Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFEMP1Q12805 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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