Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms