Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms