Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms