Protein–RNA interactions for Protein: Q08999

RBL2, Retinoblastoma-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL2Q08999 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBL2Q08999 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms