Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC33.67■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms