Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms