Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KRTAP1-1Q07627 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KRTAP1-1Q07627 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KRTAP1-1Q07627 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KRTAP1-1Q07627 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KRTAP1-1Q07627 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KRTAP1-1Q07627 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KRTAP1-1Q07627 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KRTAP1-1Q07627 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KRTAP1-1Q07627 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KRTAP1-1Q07627 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KRTAP1-1Q07627 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KRTAP1-1Q07627 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KRTAP1-1Q07627 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KRTAP1-1Q07627 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KRTAP1-1Q07627 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KRTAP1-1Q07627 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KRTAP1-1Q07627 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KRTAP1-1Q07627 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KRTAP1-1Q07627 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KRTAP1-1Q07627 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KRTAP1-1Q07627 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KRTAP1-1Q07627 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KRTAP1-1Q07627 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KRTAP1-1Q07627 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP1-1Q07627 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms