Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms