Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FMODQ06828 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FMODQ06828 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FMODQ06828 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FMODQ06828 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FMODQ06828 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FMODQ06828 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FMODQ06828 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FMODQ06828 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FMODQ06828 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FMODQ06828 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FMODQ06828 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FMODQ06828 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FMODQ06828 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FMODQ06828 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FMODQ06828 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FMODQ06828 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FMODQ06828 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FMODQ06828 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FMODQ06828 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FMODQ06828 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FMODQ06828 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FMODQ06828 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FMODQ06828 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FMODQ06828 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FMODQ06828 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FMODQ06828 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FMODQ06828 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FMODQ06828 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FMODQ06828 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FMODQ06828 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FMODQ06828 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FMODQ06828 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FMODQ06828 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FMODQ06828 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FMODQ06828 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FMODQ06828 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FMODQ06828 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FMODQ06828 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FMODQ06828 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FMODQ06828 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FMODQ06828 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FMODQ06828 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FMODQ06828 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FMODQ06828 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FMODQ06828 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FMODQ06828 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FMODQ06828 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FMODQ06828 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FMODQ06828 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FMODQ06828 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FMODQ06828 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FMODQ06828 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FMODQ06828 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FMODQ06828 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FMODQ06828 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FMODQ06828 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FMODQ06828 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FMODQ06828 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FMODQ06828 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FMODQ06828 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FMODQ06828 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FMODQ06828 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FMODQ06828 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FMODQ06828 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FMODQ06828 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FMODQ06828 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FMODQ06828 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FMODQ06828 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FMODQ06828 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FMODQ06828 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FMODQ06828 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FMODQ06828 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FMODQ06828 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FMODQ06828 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FMODQ06828 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FMODQ06828 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FMODQ06828 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FMODQ06828 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FMODQ06828 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FMODQ06828 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FMODQ06828 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FMODQ06828 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
FMODQ06828 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FMODQ06828 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FMODQ06828 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FMODQ06828 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FMODQ06828 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FMODQ06828 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FMODQ06828 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FMODQ06828 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FMODQ06828 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FMODQ06828 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FMODQ06828 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FMODQ06828 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FMODQ06828 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FMODQ06828 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FMODQ06828 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FMODQ06828 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FMODQ06828 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms