Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms