Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A2Q05940 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A2Q05940 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A2Q05940 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A2Q05940 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A2Q05940 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A2Q05940 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A2Q05940 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A2Q05940 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A2Q05940 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A2Q05940 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A2Q05940 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A2Q05940 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A2Q05940 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A2Q05940 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A2Q05940 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A2Q05940 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A2Q05940 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A2Q05940 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A2Q05940 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A2Q05940 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A2Q05940 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A2Q05940 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A2Q05940 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A2Q05940 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A2Q05940 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A2Q05940 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A2Q05940 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A2Q05940 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A2Q05940 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A2Q05940 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A2Q05940 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A2Q05940 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A2Q05940 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A2Q05940 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A2Q05940 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms