Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNB3Q05901 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
CHRNB3Q05901 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNB3Q05901 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms