Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms