Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARID5AQ03989 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms