Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms