Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms