Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF17Q02223 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF17Q02223 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF17Q02223 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF17Q02223 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF17Q02223 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF17Q02223 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF17Q02223 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF17Q02223 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF17Q02223 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF17Q02223 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF17Q02223 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF17Q02223 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF17Q02223 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF17Q02223 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF17Q02223 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF17Q02223 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF17Q02223 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF17Q02223 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF17Q02223 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF17Q02223 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF17Q02223 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms