Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms