Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDK3Q00526 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms