Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2C1P98194 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms