Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM193AP78312 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM193AP78312 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM193AP78312 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM193AP78312 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM193AP78312 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM193AP78312 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM193AP78312 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM193AP78312 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM193AP78312 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM193AP78312 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM193AP78312 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM193AP78312 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM193AP78312 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM193AP78312 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM193AP78312 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM193AP78312 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM193AP78312 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM193AP78312 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM193AP78312 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM193AP78312 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM193AP78312 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM193AP78312 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM193AP78312 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM193AP78312 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM193AP78312 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM193AP78312 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM193AP78312 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM193AP78312 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM193AP78312 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM193AP78312 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM193AP78312 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM193AP78312 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM193AP78312 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms