Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCS1P62166 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCS1P62166 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCS1P62166 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCS1P62166 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCS1P62166 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NCS1P62166 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NCS1P62166 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NCS1P62166 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCS1P62166 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCS1P62166 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCS1P62166 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCS1P62166 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCS1P62166 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCS1P62166 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCS1P62166 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCS1P62166 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCS1P62166 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NCS1P62166 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCS1P62166 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCS1P62166 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCS1P62166 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCS1P62166 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCS1P62166 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NCS1P62166 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCS1P62166 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCS1P62166 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCS1P62166 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCS1P62166 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCS1P62166 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCS1P62166 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCS1P62166 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCS1P62166 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCS1P62166 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCS1P62166 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCS1P62166 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCS1P62166 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCS1P62166 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCS1P62166 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCS1P62166 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCS1P62166 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCS1P62166 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCS1P62166 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NCS1P62166 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCS1P62166 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCS1P62166 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCS1P62166 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCS1P62166 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCS1P62166 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCS1P62166 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCS1P62166 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCS1P62166 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCS1P62166 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCS1P62166 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCS1P62166 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCS1P62166 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCS1P62166 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCS1P62166 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCS1P62166 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCS1P62166 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCS1P62166 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCS1P62166 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCS1P62166 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCS1P62166 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCS1P62166 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCS1P62166 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCS1P62166 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCS1P62166 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCS1P62166 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCS1P62166 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCS1P62166 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCS1P62166 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCS1P62166 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCS1P62166 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCS1P62166 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCS1P62166 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCS1P62166 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCS1P62166 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCS1P62166 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCS1P62166 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCS1P62166 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCS1P62166 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCS1P62166 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCS1P62166 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCS1P62166 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCS1P62166 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCS1P62166 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCS1P62166 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCS1P62166 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCS1P62166 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCS1P62166 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCS1P62166 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCS1P62166 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCS1P62166 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCS1P62166 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCS1P62166 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCS1P62166 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCS1P62166 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCS1P62166 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCS1P62166 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms