Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms