Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCDC1P59894 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCDC1P59894 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCDC1P59894 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCDC1P59894 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCDC1P59894 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCDC1P59894 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCDC1P59894 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCDC1P59894 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCDC1P59894 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCDC1P59894 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCDC1P59894 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCDC1P59894 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCDC1P59894 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCDC1P59894 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCDC1P59894 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCDC1P59894 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCDC1P59894 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCDC1P59894 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCDC1P59894 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DCDC1P59894 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DCDC1P59894 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCDC1P59894 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCDC1P59894 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCDC1P59894 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCDC1P59894 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCDC1P59894 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCDC1P59894 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCDC1P59894 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCDC1P59894 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCDC1P59894 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCDC1P59894 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms