Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX17P56962 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX17P56962 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX17P56962 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX17P56962 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX17P56962 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX17P56962 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX17P56962 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX17P56962 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX17P56962 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX17P56962 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
STX17P56962 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX17P56962 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX17P56962 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX17P56962 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX17P56962 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX17P56962 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX17P56962 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX17P56962 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX17P56962 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX17P56962 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX17P56962 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX17P56962 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX17P56962 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
STX17P56962 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX17P56962 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX17P56962 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX17P56962 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX17P56962 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX17P56962 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX17P56962 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX17P56962 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX17P56962 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX17P56962 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX17P56962 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX17P56962 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX17P56962 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX17P56962 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX17P56962 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX17P56962 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX17P56962 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX17P56962 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
STX17P56962 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX17P56962 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX17P56962 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX17P56962 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX17P56962 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX17P56962 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX17P56962 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX17P56962 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX17P56962 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX17P56962 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX17P56962 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX17P56962 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX17P56962 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX17P56962 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX17P56962 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
STX17P56962 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX17P56962 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX17P56962 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX17P56962 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX17P56962 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX17P56962 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX17P56962 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX17P56962 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX17P56962 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX17P56962 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX17P56962 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX17P56962 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX17P56962 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX17P56962 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX17P56962 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX17P56962 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STX17P56962 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STX17P56962 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STX17P56962 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STX17P56962 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STX17P56962 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STX17P56962 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STX17P56962 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
STX17P56962 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STX17P56962 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STX17P56962 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STX17P56962 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STX17P56962 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STX17P56962 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STX17P56962 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STX17P56962 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX17P56962 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
STX17P56962 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX17P56962 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX17P56962 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX17P56962 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX17P56962 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX17P56962 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX17P56962 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX17P56962 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX17P56962 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
STX17P56962 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX17P56962 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms