Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GSCP56915 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GSCP56915 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GSCP56915 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GSCP56915 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GSCP56915 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GSCP56915 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GSCP56915 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GSCP56915 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GSCP56915 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GSCP56915 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GSCP56915 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GSCP56915 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GSCP56915 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GSCP56915 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GSCP56915 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GSCP56915 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GSCP56915 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GSCP56915 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GSCP56915 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GSCP56915 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GSCP56915 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GSCP56915 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GSCP56915 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GSCP56915 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSCP56915 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSCP56915 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSCP56915 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSCP56915 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSCP56915 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSCP56915 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSCP56915 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSCP56915 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSCP56915 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GSCP56915 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSCP56915 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSCP56915 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSCP56915 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSCP56915 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSCP56915 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSCP56915 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSCP56915 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSCP56915 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSCP56915 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSCP56915 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSCP56915 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSCP56915 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GSCP56915 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
GSCP56915 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GSCP56915 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GSCP56915 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GSCP56915 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSCP56915 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSCP56915 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GSCP56915 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSCP56915 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSCP56915 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSCP56915 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSCP56915 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSCP56915 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSCP56915 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSCP56915 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSCP56915 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSCP56915 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSCP56915 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSCP56915 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSCP56915 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSCP56915 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSCP56915 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSCP56915 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSCP56915 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSCP56915 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSCP56915 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSCP56915 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSCP56915 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSCP56915 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSCP56915 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSCP56915 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSCP56915 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSCP56915 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSCP56915 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSCP56915 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSCP56915 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSCP56915 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSCP56915 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSCP56915 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSCP56915 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSCP56915 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSCP56915 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSCP56915 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSCP56915 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSCP56915 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSCP56915 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSCP56915 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSCP56915 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSCP56915 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSCP56915 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSCP56915 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSCP56915 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GSCP56915 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms