Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SH3BGRP55822 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SH3BGRP55822 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms