Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL23P55773 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL23P55773 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL23P55773 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL23P55773 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCL23P55773 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCL23P55773 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCL23P55773 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCL23P55773 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCL23P55773 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCL23P55773 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCL23P55773 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCL23P55773 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCL23P55773 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCL23P55773 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCL23P55773 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCL23P55773 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCL23P55773 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCL23P55773 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCL23P55773 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCL23P55773 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCL23P55773 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL23P55773 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL23P55773 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL23P55773 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL23P55773 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL23P55773 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL23P55773 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL23P55773 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL23P55773 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL23P55773 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL23P55773 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL23P55773 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL23P55773 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL23P55773 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL23P55773 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL23P55773 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL23P55773 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL23P55773 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL23P55773 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL23P55773 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL23P55773 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL23P55773 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL23P55773 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL23P55773 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL23P55773 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL23P55773 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL23P55773 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL23P55773 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL23P55773 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL23P55773 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL23P55773 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL23P55773 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL23P55773 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL23P55773 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL23P55773 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL23P55773 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL23P55773 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL23P55773 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL23P55773 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL23P55773 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL23P55773 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL23P55773 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL23P55773 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL23P55773 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL23P55773 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL23P55773 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL23P55773 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL23P55773 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL23P55773 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL23P55773 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL23P55773 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL23P55773 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL23P55773 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL23P55773 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL23P55773 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL23P55773 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL23P55773 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL23P55773 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL23P55773 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL23P55773 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL23P55773 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL23P55773 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL23P55773 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL23P55773 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL23P55773 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL23P55773 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL23P55773 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL23P55773 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL23P55773 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL23P55773 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL23P55773 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL23P55773 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL23P55773 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL23P55773 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL23P55773 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL23P55773 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL23P55773 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL23P55773 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL23P55773 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms