Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATN1P54259 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATN1P54259 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATN1P54259 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATN1P54259 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATN1P54259 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATN1P54259 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATN1P54259 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATN1P54259 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATN1P54259 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATN1P54259 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATN1P54259 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATN1P54259 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATN1P54259 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATN1P54259 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATN1P54259 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATN1P54259 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATN1P54259 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATN1P54259 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATN1P54259 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATN1P54259 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATN1P54259 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATN1P54259 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATN1P54259 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATN1P54259 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATN1P54259 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATN1P54259 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATN1P54259 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATN1P54259 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATN1P54259 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATN1P54259 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATN1P54259 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATN1P54259 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATN1P54259 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATN1P54259 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATN1P54259 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATN1P54259 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATN1P54259 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATN1P54259 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATN1P54259 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATN1P54259 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATN1P54259 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATN1P54259 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATN1P54259 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATN1P54259 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATN1P54259 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATN1P54259 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATN1P54259 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATN1P54259 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATN1P54259 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATN1P54259 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATN1P54259 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATN1P54259 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATN1P54259 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATN1P54259 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATN1P54259 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATN1P54259 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATN1P54259 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATN1P54259 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATN1P54259 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATN1P54259 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATN1P54259 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATN1P54259 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATN1P54259 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATN1P54259 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATN1P54259 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATN1P54259 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATN1P54259 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATN1P54259 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATN1P54259 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATN1P54259 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATN1P54259 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATN1P54259 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATN1P54259 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATN1P54259 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATN1P54259 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATN1P54259 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATN1P54259 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATN1P54259 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATN1P54259 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATN1P54259 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATN1P54259 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATN1P54259 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATN1P54259 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATN1P54259 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATN1P54259 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATN1P54259 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATN1P54259 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATN1P54259 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATN1P54259 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATN1P54259 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATN1P54259 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATN1P54259 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATN1P54259 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATN1P54259 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATN1P54259 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATN1P54259 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATN1P54259 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATN1P54259 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATN1P54259 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms