Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMTNP53814 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMTNP53814 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMTNP53814 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMTNP53814 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMTNP53814 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMTNP53814 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMTNP53814 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMTNP53814 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMTNP53814 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMTNP53814 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMTNP53814 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMTNP53814 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMTNP53814 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMTNP53814 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMTNP53814 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMTNP53814 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMTNP53814 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMTNP53814 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMTNP53814 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMTNP53814 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMTNP53814 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMTNP53814 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMTNP53814 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMTNP53814 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMTNP53814 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMTNP53814 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMTNP53814 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMTNP53814 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMTNP53814 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMTNP53814 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMTNP53814 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMTNP53814 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMTNP53814 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMTNP53814 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMTNP53814 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMTNP53814 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMTNP53814 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMTNP53814 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMTNP53814 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMTNP53814 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMTNP53814 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMTNP53814 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMTNP53814 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMTNP53814 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMTNP53814 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMTNP53814 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMTNP53814 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMTNP53814 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMTNP53814 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMTNP53814 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMTNP53814 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMTNP53814 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMTNP53814 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMTNP53814 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMTNP53814 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMTNP53814 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMTNP53814 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMTNP53814 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMTNP53814 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMTNP53814 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMTNP53814 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMTNP53814 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMTNP53814 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMTNP53814 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMTNP53814 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMTNP53814 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMTNP53814 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMTNP53814 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMTNP53814 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMTNP53814 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMTNP53814 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMTNP53814 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMTNP53814 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMTNP53814 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMTNP53814 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMTNP53814 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMTNP53814 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMTNP53814 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMTNP53814 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMTNP53814 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMTNP53814 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMTNP53814 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMTNP53814 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMTNP53814 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMTNP53814 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMTNP53814 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMTNP53814 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMTNP53814 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMTNP53814 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMTNP53814 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMTNP53814 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMTNP53814 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMTNP53814 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMTNP53814 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMTNP53814 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMTNP53814 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMTNP53814 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMTNP53814 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMTNP53814 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms