Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDST1P52848 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NDST1P52848 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDST1P52848 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDST1P52848 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDST1P52848 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NDST1P52848 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDST1P52848 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NDST1P52848 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST1P52848 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST1P52848 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST1P52848 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST1P52848 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST1P52848 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST1P52848 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST1P52848 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST1P52848 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST1P52848 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST1P52848 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDST1P52848 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NDST1P52848 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDST1P52848 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDST1P52848 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDST1P52848 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDST1P52848 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NDST1P52848 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
NDST1P52848 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NDST1P52848 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NDST1P52848 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NDST1P52848 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NDST1P52848 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDST1P52848 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDST1P52848 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NDST1P52848 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDST1P52848 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDST1P52848 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NDST1P52848 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NDST1P52848 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST1P52848 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST1P52848 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST1P52848 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST1P52848 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST1P52848 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST1P52848 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST1P52848 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST1P52848 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST1P52848 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST1P52848 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST1P52848 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST1P52848 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST1P52848 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST1P52848 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST1P52848 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST1P52848 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST1P52848 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST1P52848 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST1P52848 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST1P52848 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST1P52848 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST1P52848 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST1P52848 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST1P52848 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST1P52848 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST1P52848 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST1P52848 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST1P52848 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDST1P52848 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDST1P52848 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDST1P52848 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDST1P52848 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDST1P52848 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDST1P52848 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDST1P52848 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDST1P52848 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDST1P52848 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDST1P52848 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDST1P52848 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NDST1P52848 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NDST1P52848 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDST1P52848 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDST1P52848 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDST1P52848 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDST1P52848 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDST1P52848 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDST1P52848 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDST1P52848 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDST1P52848 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDST1P52848 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDST1P52848 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDST1P52848 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDST1P52848 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDST1P52848 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDST1P52848 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDST1P52848 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NDST1P52848 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NDST1P52848 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDST1P52848 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDST1P52848 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDST1P52848 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDST1P52848 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms