Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms