Protein–RNA interactions for Protein: P51795

CLCN5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN5P51795 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CLCN5P51795 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLCN5P51795 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms