Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SMARCA2P51531 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.19■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
SMARCA2P51531 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms