Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB27AP51159 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms