Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETV1P50549 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETV1P50549 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETV1P50549 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETV1P50549 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETV1P50549 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETV1P50549 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETV1P50549 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETV1P50549 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETV1P50549 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETV1P50549 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETV1P50549 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ETV1P50549 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ETV1P50549 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETV1P50549 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETV1P50549 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETV1P50549 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETV1P50549 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETV1P50549 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV1P50549 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV1P50549 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV1P50549 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV1P50549 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV1P50549 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV1P50549 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV1P50549 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV1P50549 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV1P50549 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV1P50549 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV1P50549 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV1P50549 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV1P50549 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV1P50549 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV1P50549 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV1P50549 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV1P50549 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETV1P50549 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETV1P50549 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETV1P50549 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETV1P50549 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETV1P50549 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETV1P50549 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETV1P50549 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETV1P50549 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETV1P50549 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETV1P50549 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETV1P50549 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETV1P50549 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETV1P50549 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETV1P50549 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETV1P50549 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETV1P50549 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETV1P50549 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETV1P50549 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETV1P50549 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETV1P50549 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETV1P50549 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETV1P50549 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETV1P50549 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETV1P50549 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETV1P50549 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETV1P50549 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ETV1P50549 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETV1P50549 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETV1P50549 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETV1P50549 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETV1P50549 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETV1P50549 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ETV1P50549 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETV1P50549 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ETV1P50549 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETV1P50549 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETV1P50549 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETV1P50549 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETV1P50549 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETV1P50549 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETV1P50549 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETV1P50549 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETV1P50549 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETV1P50549 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETV1P50549 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETV1P50549 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETV1P50549 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETV1P50549 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETV1P50549 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ETV1P50549 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETV1P50549 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETV1P50549 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETV1P50549 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETV1P50549 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETV1P50549 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETV1P50549 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETV1P50549 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETV1P50549 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETV1P50549 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETV1P50549 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETV1P50549 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETV1P50549 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETV1P50549 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETV1P50549 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms