Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSNK1EP49674 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSNK1EP49674 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSNK1EP49674 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSNK1EP49674 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSNK1EP49674 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSNK1EP49674 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK1EP49674 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK1EP49674 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK1EP49674 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK1EP49674 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK1EP49674 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK1EP49674 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK1EP49674 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK1EP49674 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK1EP49674 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK1EP49674 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK1EP49674 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK1EP49674 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK1EP49674 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK1EP49674 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK1EP49674 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK1EP49674 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK1EP49674 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK1EP49674 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK1EP49674 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK1EP49674 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK1EP49674 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK1EP49674 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK1EP49674 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK1EP49674 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK1EP49674 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK1EP49674 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK1EP49674 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK1EP49674 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK1EP49674 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK1EP49674 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK1EP49674 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK1EP49674 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms