Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK8P49336 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK8P49336 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK8P49336 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK8P49336 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK8P49336 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK8P49336 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK8P49336 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK8P49336 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK8P49336 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK8P49336 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK8P49336 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK8P49336 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK8P49336 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK8P49336 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK8P49336 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK8P49336 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK8P49336 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK8P49336 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK8P49336 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK8P49336 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK8P49336 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK8P49336 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK8P49336 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK8P49336 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK8P49336 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK8P49336 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK8P49336 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK8P49336 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK8P49336 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK8P49336 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK8P49336 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK8P49336 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK8P49336 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK8P49336 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK8P49336 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK8P49336 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK8P49336 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK8P49336 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK8P49336 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK8P49336 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK8P49336 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK8P49336 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK8P49336 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK8P49336 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK8P49336 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK8P49336 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK8P49336 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK8P49336 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK8P49336 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK8P49336 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK8P49336 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK8P49336 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK8P49336 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK8P49336 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK8P49336 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK8P49336 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK8P49336 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK8P49336 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK8P49336 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK8P49336 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDK8P49336 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDK8P49336 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDK8P49336 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDK8P49336 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDK8P49336 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDK8P49336 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDK8P49336 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK8P49336 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK8P49336 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK8P49336 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK8P49336 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK8P49336 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK8P49336 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK8P49336 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK8P49336 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK8P49336 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK8P49336 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK8P49336 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK8P49336 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK8P49336 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK8P49336 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK8P49336 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK8P49336 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK8P49336 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK8P49336 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK8P49336 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK8P49336 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK8P49336 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK8P49336 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK8P49336 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK8P49336 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK8P49336 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK8P49336 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK8P49336 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK8P49336 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK8P49336 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK8P49336 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK8P49336 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK8P49336 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms