Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCLMP48507 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCLMP48507 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCLMP48507 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCLMP48507 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCLMP48507 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCLMP48507 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GCLMP48507 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCLMP48507 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCLMP48507 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCLMP48507 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCLMP48507 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GCLMP48507 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GCLMP48507 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCLMP48507 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCLMP48507 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCLMP48507 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCLMP48507 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCLMP48507 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCLMP48507 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCLMP48507 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCLMP48507 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCLMP48507 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GCLMP48507 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GCLMP48507 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GCLMP48507 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GCLMP48507 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCLMP48507 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCLMP48507 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCLMP48507 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GCLMP48507 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCLMP48507 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCLMP48507 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GCLMP48507 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCLMP48507 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCLMP48507 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCLMP48507 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCLMP48507 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCLMP48507 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCLMP48507 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCLMP48507 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCLMP48507 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCLMP48507 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCLMP48507 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCLMP48507 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCLMP48507 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCLMP48507 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCLMP48507 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCLMP48507 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCLMP48507 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCLMP48507 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCLMP48507 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCLMP48507 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCLMP48507 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCLMP48507 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCLMP48507 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCLMP48507 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCLMP48507 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GCLMP48507 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCLMP48507 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCLMP48507 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCLMP48507 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCLMP48507 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCLMP48507 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCLMP48507 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCLMP48507 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCLMP48507 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GCLMP48507 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCLMP48507 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCLMP48507 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCLMP48507 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCLMP48507 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCLMP48507 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCLMP48507 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCLMP48507 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCLMP48507 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCLMP48507 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCLMP48507 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCLMP48507 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCLMP48507 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCLMP48507 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCLMP48507 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCLMP48507 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCLMP48507 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCLMP48507 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCLMP48507 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCLMP48507 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCLMP48507 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCLMP48507 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCLMP48507 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GCLMP48507 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCLMP48507 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCLMP48507 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCLMP48507 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCLMP48507 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCLMP48507 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GCLMP48507 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCLMP48507 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCLMP48507 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCLMP48507 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms