Protein–RNA interactions for Protein: P47211

GALR1, Galanin receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALR1P47211 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GALR1P47211 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GALR1P47211 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GALR1P47211 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GALR1P47211 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GALR1P47211 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GALR1P47211 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GALR1P47211 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GALR1P47211 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GALR1P47211 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GALR1P47211 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GALR1P47211 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GALR1P47211 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GALR1P47211 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GALR1P47211 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GALR1P47211 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GALR1P47211 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GALR1P47211 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GALR1P47211 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GALR1P47211 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GALR1P47211 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GALR1P47211 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GALR1P47211 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GALR1P47211 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GALR1P47211 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GALR1P47211 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GALR1P47211 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GALR1P47211 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GALR1P47211 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GALR1P47211 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GALR1P47211 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GALR1P47211 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GALR1P47211 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GALR1P47211 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GALR1P47211 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GALR1P47211 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GALR1P47211 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GALR1P47211 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GALR1P47211 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GALR1P47211 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GALR1P47211 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GALR1P47211 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GALR1P47211 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GALR1P47211 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GALR1P47211 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GALR1P47211 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GALR1P47211 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GALR1P47211 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GALR1P47211 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GALR1P47211 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GALR1P47211 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GALR1P47211 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GALR1P47211 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GALR1P47211 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GALR1P47211 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GALR1P47211 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
GALR1P47211 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GALR1P47211 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GALR1P47211 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GALR1P47211 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GALR1P47211 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GALR1P47211 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GALR1P47211 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GALR1P47211 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GALR1P47211 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GALR1P47211 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GALR1P47211 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GALR1P47211 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GALR1P47211 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GALR1P47211 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GALR1P47211 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GALR1P47211 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GALR1P47211 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GALR1P47211 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GALR1P47211 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GALR1P47211 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GALR1P47211 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GALR1P47211 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GALR1P47211 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GALR1P47211 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GALR1P47211 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GALR1P47211 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GALR1P47211 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GALR1P47211 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GALR1P47211 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GALR1P47211 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GALR1P47211 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GALR1P47211 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GALR1P47211 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GALR1P47211 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GALR1P47211 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GALR1P47211 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GALR1P47211 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GALR1P47211 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GALR1P47211 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GALR1P47211 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GALR1P47211 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GALR1P47211 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GALR1P47211 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GALR1P47211 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms