Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms